En 2001, 35 pays font construire un pénitencier pour les criminels et terroristes meurtriers les plus dangereux du monde : la prison international souterraine de haute sécurité, la New Alcatraz (nouvelle alcatraz), base militaire américaine à sécurité maximale, à Douvres, à Northeastern Antarctique, au milieu du continent de l’Antarctique à 20 km au nord du pôle sud. Cependant, les personnes se trouvant sur place vont vite faire face à un boa géant sortit des entrailles de la terre, prêt à les dévorer.
Des scientifiques testent un produit qui augmente l'agressivité de l'homme et des animaux. Ils donnent naissance à une créature mutante ressemblant à une sorte de serpent géant ; un monstre de plusieurs mètres de long qui sème la terreur là où il passe...
Le Dr Nikki Riley vole des pythons dans un laboratoire et les rejette dans les Everglades. Ceux-ci commencent alors à dévorer les alligators de la région. Terry O'Hara, la chef des rangers, engage des chasseurs d'alligators (à qui elle avait interdit la chasse à cause de la population d'alligators qui avait beaucoup chuté) et envoie certains rangers pour tuer les pythons. Son fiancé va aussi à la poursuite des serpents. Plusieurs meurent dont le fiancé de Terry. Pour venger son amour, elle va, avec son amie Angie, donner aux alligators des poulets radioactifs qui les rendront immenses. Ils pondent des œufs dont certains sont dévorés par les pythons qui ont maintenant le même gène que les alligators. Les deux sortes de créatures deviennent alors de géantes et féroces machines à tuer.
Les recherches sur l'orchidée de sang se poursuivent, elles mènent encore une fois à la création d'un serpent génétiquement modifié à l’agressivité sur-développé.
Victime d'un cancer du cerveau, George States n'a plus que six mois à vivre. Il décide de se rendre en Inde dans l’espoir de guérir grâce à un objet mystique : le Naagmani. En effet, quiconque possède le Naagmani devient immortel. Reste que bien évidemment, l’objet n’est pas des plus accessibles. Il se trouve en réalité entre les mains de Nāginī, une déesse serpent capable de prendre forme humaine. Se basant sur une légende locale bien connue, States fait donc capturer l’amant de la divinité et entend bien l’utiliser comme moyen de pression : Nāginī retrouvera son cobra royal de conjoint si elle accepte de remettre le Naagmani. La merveilleuse déesse ne l’entend cependant pas de cette oreille et part en quête de son compagnon, non sans laisser quelques cadavres sur son passage…
Un mercenaire accepte une mission à la demande d'un milliardaire, celle-ci consiste à chasser un serpent géant dont le sang aurait des propriétés curatives miraculeuse.
Un homme d’affaires ramène d’un de ses voyages un immense python aux États-Unis. Mais le monstre s’échappe et commence à faire quelques victimes parmi les habitants de la ville. Un agent du FBI, spécialiste des serpents propose de combattre la créature à l’aide d’un autre serpent géant, un boa constricteur…
Khin, Soet ...Phrae et Sida, de jeunes étudiants, partent en montgolfière survoler l'épaisse forêt tropicale du parc national de Khao Yai afin de retrouver leur ami Pana, un jeune photographe qui vient de disparaître. Go, qui a le vertige, préfère rester au sol et promet de les aider. Les jeunes aventuriers sont pris dans une violente tempête et atterrissent en catastrophe dans les arbres au milieu de la jungle. Leur ballon est détruit. Ils se réfugient dans une grotte. Ils découvrent des gravures rupestres et un très ancien sanctuaire mais aussi le protecteur des lieux, un gigantesque serpent qui les attaque. Ils doivent fuir dans la forêt pour essayer d'échapper au terrible monstre.
Sur une île, des scientifiques font des expériences sur des animaux. Quelques journalistes décident d'enquêter d'étranges meurtres causés par des dragons de Komodo et des cobras.
Le Méga Shark revient mais il va devoir faire face à un crocodile géant : le Crocosaurus. Attaquant beaucoup d'humains, les deux monstres se battent en duel. L'amiral Calvin et l'agent Hutchinson décident alors d'envoyer le lieutenant Terry McKormick et le chasseur Nigel Putman mettre un terme aux attaques des deux monstres.
Une femme est victime d'une malédiction maya, qui entraîne l'éclosion d’œufs de serpents dans son ventre. Ces animaux s'échappent. Pour les retrouver, elle rejoint un chaman maya à Los Angeles pour annuler la malédiction. Elle récupère les serpents et les transporte avec elle dans un vase, à bord d'un train. Des bandits attaquent celui-ci, laissant les serpents s'échapper, et mettant en danger les autres passagers.