Dans chaque partie, un étranger et un résident, d'une vingtaine d'années tous les deux, essayent de passer outre les barrières culturelles et linguistiques et d'explorer quelque chose ayant rapport avec l'amour.
Depuis son enfance, Machisu Kuramochi passe ses journées à peindre et à dessiner. Toute sa vie est vouée à cette passion dévorante. Enfant, il est le fils d'un riche collectionneur d'art. Mais à la suite de la faillite de son père, sa mère le place chez son oncle, paysan qui ne comprend pas sa passion pour la peinture et le malmène. Puis il vit en orphelinat. Adulte, il exerce des petits boulots qui lui permettent de peindre à ses heures de temps libre. Il rencontre celle qui sera son épouse et l'aidera dans son art. Il reste pauvre, et ses toiles n'ont pas de succès auprès du marchand d'art. Mais il continue d'expérimenter différentes techniques de peinture : projection de peinture, fresques sur les rideaux des commerçants du quartier, recherche d'inspiration en conditions extrêmes. Sa fille est lassée de ses frasques, elle quitte ses parents. Mais Machisu Kuramochi persiste, et demeure artiste jusqu'au bout.
À l'aube d'une carrière universitaire, l'architecte Kawamura passe des vacances en Europe. À Lisbonne, il lie connaissance avec Naoko Toba, une importatrice d'objets d'art. Profondément ébranlée par la disparition de ses parents lors du bombardement de la ville de Nagasaki, Naoko mène une vie d'apatride après avoir volontairement oublié son pays d'origine. Kawamura est, pour sa part, hanté par la vision d'un dessin de cathédrale entrevu à Nagasaki des années auparavant. Retrouver la cathédrale représentée dans ce croquis est, sans doute, la motivation principale de son voyage européen…
Tetsurô est rentré sur Terre qui est aux mains des soldats de la reine Prométhium. Maetel lui demande de le rejoindre afin de retrouver le Galaxy Express 999 et d'y faire un nouveau voyage. Il devra combattre Faust aidé du capitaine Harlock.
L'histoire est celle, assez classique d'une guerre des clans ourdie par le plus puissant d'entre eux pour les contrôler tous, Mais une petit groupe d'irréductible se dégage et décide de se battre jusqu'au bout. Ce groupe c'est celui d'Higuchi et de Kunihiko, deux dur de dur qui n'acceptent pas de se faire gober sur tapis vert par leurs anciens rivaux et vont donc entrainer avec eux quelques yakuzas décidés pour défendre leur clan.
Hideo s'est acheté une poupée gonflable qu'il appelle Nozomi. Pour lui, cette poupée est une compagne intime : il l'habille, lui parle, dîne avec elle, et a également des relations sexuelles. Cependant, à l'insu de Hideo, Nozomi, petit à petit s'anime et s'aperçoit qu'elle a été créée avec un cœur. Un matin alors qu’Hideo est parti au travail, Nozomi se lève, s'habille et décide d’explorer le monde extérieur avec les yeux d’une petite fille ; elle trouve un travail dans une boutique qui vend des vidéos et fait petit à petit l'apprentissage de la vie des humains, de leurs sentiments et de leur solitude et enfin de leur mort.
Kei Nagai (Takeru Satoh) meurt dans un accident de la route et découvre qu'il est un « Ajin », un être vivant immortel. Les « Ajin » sont pourchassés par les humains qui veulent les rendre mortels. Kei essaie alors de cacher sa véritable nature aux hommes mais un groupe de « Ajin » lui demande de les rejoindre pour préparer une offensive contre les humains.
A.K.A. Serial Killer raconte l'histoire de Norio Nagayama, jeune tueur en série de 19 ans qui avait commis quatre meurtres en des lieux différents. Ce scénario permet à Adachi de mettre en avant la « Théorie du paysage », dont il est un des initiateurs, et qui postule que les paysages, quels qu'ils soient, sont des expressions du pouvoir politique dominant : « Tous les paysages que nous voyons au quotidien, et surtout les beaux paysages reproduits sur carte postale, sont fondamentalement liés à une figure du pouvoir dominant ». Pour le réalisateur, Norio Nagayama aurait donc été influencé par son environnement qui l'aurait transformé en assassin.
Le 16 juillet 1988, Tokyo est détruite.
Trente-et-un ans plus tard, après la Troisième Guerre mondiale, en 2019, Neo-Tokyo est une mégalopole corrompue et sillonnée par des bandes de jeunes motards désœuvrés et drogués. Une nuit, l'un d'eux, Tetsuo, a un accident en essayant d'éviter ce qui semble être d'abord un jeune garçon mais qui a un visage de vieillard. Il est capturé par l'armée et fait l'objet de nombreux tests dans le cadre d'un projet militaire secret visant à repérer et à former des êtres possédant des prédispositions à des pouvoirs psychiques (télépathie, téléportation, télékinésie…).