Pendant la dynastie Quin, une unité d'élite composée de criminels lutte contre le crime grâce à la "flying guillotine", une arme redoutable. Alors qu'ils réalisent qu'ils s'en sont pris à des innocents, ils décident de se retourner vers leurs dirigeants.
Chine, fin de la dynastie Ming. Yu, un eunuque sanguinaire, fait régner la terreur et cherche à éliminer tous ses opposants. Mais un groupe de rebelles, mené par le résistant Zhao, prépare la riposte...
Vingt ans avant les événements du premier film, lord Shen, fils unique du dirigeant du clan des Paons, cherche à maitriser la poudre des feux d’artifices pour en faire une arme redoutable. Sachant par une divinatrice qu’il sera vaincu par un guerrier noir et blanc s'il poursuit sur la mauvaise voie, il ordonne le massacre de tous les villages panda de Chine. Les parents de Shen prennent alors la décision de rejeter leur fils et de l’envoyer en exil pour toujours.
Master Kung and Lo Pa are two police officers of White Horse City, who have high skills but are underused. An opportunity to prove themselves arises when a robbery takes place at the home of the city's richest man, Ho Pak Man, in which his whole family is killed and the family treasure, the "White Jade Goddess of Mercy," is stolen. Their chance for glory is cut short, however, when the "Police God" Tit Mo Ching is called in to investigate the case. He bars Kung and Lo Pa from further participation in the investigation because of their low status.
Deux bandits s'attaquent à une fabrique de papier et se font tuer dans l'altercation qui s'ensuit. Un policier est dépêché sur place pour mener l'enquête. Cet événement attire l'attention d'autres bandits sur le village et sur un habitant en particulier.
Aux débuts de la dynastie Ming, l'Empereur décide de créer un corps d'élite appelé : le Jin Gi Wei, afin de protéger les intérêts de la Cour Impériale, et de veiller au maintien de la dynastie Ming.
Dans la Chine antique, Zeng Jing, une tueuse experte, se retrouve en possession de reliques dotées d'un super pouvoir. Elle décide alors de ramener ces restes à leurs endroits d'origine. Mais elle se retrouve face à une bande d'assassins, qui veulent mettre la main sur ces précieux objets.
En l'an 690, Wu Zetian, veuve du dernier souverain chinois, est sur le point de devenir la première femme à accéder au titre d'impératrice de Chine. Une série de meurtres compromet les cérémonies de son couronnement. Pour résoudre ce mystère, elle fait sortir le juge Di Renjie de prison.
Le cruel seigneur de guerre japonais Godless, ambitieux et sans scrupule s'apprête à envahir la Chine, il fait emprisonner tous les maîtres en arts martiaux de l'Empire. Mais les deux guerriers Vent et Nuage vont se dresser contre lui. L'un en cédant à la facilité des forces obscures, l'autre en appelant à la vengeance...
La dynastie Ming vit ses derniers instants tandis que la Chine impériale est soumise au chaos le plus total. A Pékin, le désordre règne. Plusieurs factions s’affrontent, des simples bandits aux maîtres des arts-martiaux. Tous aimeraient s’emparer d’une mystérieuse carte conduisant au fabuleux trésor de l’Empereur Taizu. Cinq combattants se fondent parmi le peuple, espérant récolter de précieuses informations pour enfin trouver le trésor...
Po est un jeune panda serveur de restaurant où il travaille sous les ordres de M. Ping, son père adoptif. Il est aussi un fan des arts martiaux et idolâtre les Cinq Cyclones, cinq combattants de Kung Fu qui protègent la vallée de la Paix, où il vit. Son rêve est de devenir un combattant aussi incroyable qu'eux, en dépit de sa carrure : il est faible, obèse et maladroit.
Un adolescent américain, Jason Tripitikas (Michael Angarano), est fan de cinéma hongkongais et des classiques de Kung-fu. S'il connaît tout du Kung-fu, il ne le pratique pas. Un soir, agressé par une bande de voyous, il fait ouvrir la porte du magasin de Chinatown où il achète ses films. Le vieux commerçant chinois est blessé par balle par le chef de la bande. Avant que Jason ne s'enfuie, menacé à son tour par le voyou, le vieil homme lui confie la mission de restituer un bâton en fer somptueusement sculpté (bô) à son propriétaire. Arrivé sur le toit de l'immeuble, il se sent soudain entraîné par l'arme ; propulsé dans le vide, il se retrouve dans un autre lieu, un autre temps.
Plusieurs royaumes s'affrontent pour le contrôle du pays. Yen Feier devient impératrice après la mort de son père durant une bataille. Elle s'allie avec Muyong Xuehu pour protéger le royaume alors que son cousin envoie des tueurs l'assassiner.