The movie opens up with Brian Robeson and his mother getting a package. She later gives it to Brian revealing it to be a hatchet at the airport. When Brian gets on the single engine plane with the pilot they have a short conversation.
Alfie, un petit garçon adopté âgé 6 ans, est solitaire et timide. Il compte pour seul compagnon Timmie, son frère adoptif. Lors de la nuit de son septième anniversaire, Alfie se change en loup-garou et craint que ses parents adoptifs le rejettent. Grâce à son pouvoir, il compte se venger de Nico, son principal bourreaux, mais aussi se renseigner sur ses vrais parents. C'est alors qu'il rencontre son grand-père qui est aussi un loup-garou.
En Europe, durant la période du Paléolithique supérieur, le jeune Keda tente de retrouver sa tribu qui le croit mort après une chute lors de la chasse au bison des steppes. Durant son voyage, il va se lier avec un loup blessé, qu'il nommera plus tard Alpha.
Dans le parc national de Jasper, au Canada, une cascade sépare les territoires de deux meutes de loups : la meute de l'ouest et celle de l'est. Humphrey et Kate sont deux loups de la même meute, celle de l'ouest, mais sont de classe sociale différente : Kate est une « alpha », membre de la classe dominante d'une meute, car elle est la fille du chef de la meute, Winston, et de sa femme Ève. Elle prend son rôle très au sérieux. Quant à Humphrey, c'est un « oméga », membre de la classe sociale inférieure de la meute, et il passe ses journées à jouer avec ses amis ainsi qu'à préserver la paix. Malgré cette différence de statut, le jeune loup tombe amoureux de Kate.
Deux loups sont capturés et emmenés à des milliers de kilomètres de chez eux. Bien déterminés à retrouver leur meute, ils devront surmonter leurs différences, entamer un périple semé d'embuches et trouver l'amour au passage...
Kate et Humphrey, devenus parents, s'apprêtent à fêter leur premier Noël avec leurs trois louveteaux. Lorsque le plus jeune d'entre eux disparaît, ils décident de se lancer à sa recherche, sous la menace d'une tempête de neige.
Runt,le louveteau Omega de Kate et Humphrey, part en douce explorer la caverne hantée. Quand il y découvre une louve qui a été mise à l’écart de sa meute, il rassemble tout son courage pour l’aider, et découvre les joies d’être présent pour une amie dans le besoin.
Alvin fait fréquemment des cauchemars dans lesquels apparaissent des loups-garous. Il est persuadé que monsieur Talbot, son nouveau voisin, se transforme les nuits de pleine lune mais personne ne croit à son histoire. A l'école, les garçons travaillent sur la pièce L'Étrange Cas du docteur Jekyll et de M. Hyde. Une expérience de chimie qui tourne mal provoque le renvoi d'Alvin. Theodore le remplace dans le rôle de mister Hyde mais il est mordu par un chien…
Dans le fin fond de l'Alaska sauvage, plusieurs enfants disparaissent. Une mère de famille engage un écrivain spécialiste des loups, Russell Core, pour qu'il retrouve son petit garçon. Mais il constate que la population est très hostile à sa présence et à son investigation... La situation s'envenime lorsque le père du disparu, un soldat revenu d'Irak, se mêle à son enquête.
Le film commence par une scène avec des acteurs humains. Une grand-mère et sa petite-fille, accompagnées par leur chien, sont à la recherche d'un mémorial dans Central Park à New York. La grand-mère commence à lui raconter l'histoire de Balto. On bascule alors vers le dessin animé. Balto est un chien-loup (moitié loup, moitié husky) habitant près de la ville de Nome en Alaska. Il est rejeté par les humains et par les chiens de la ville, notamment à cause de son héritage de loup. Il a pour seul ami Boris, un jars russe et deux ours polaires nommés Muk et Luk.
Quelques mois après l'épidémie de Diphtérie enrayée, Balto et Jenna sont les heureux parents de six petits chiots. Néanmoins, même si cinq des chiots ressemblent à leur mère, un des enfants à l'apparence du chien-loup. Six semaines après la naissance des chiots, ils sont donnés aux enfants du quartier à contre-cœur par les deux parents. Mais Aleu n'est accepté par personne du fait de son apparence de loup et reste avec ses parents. Un an après, un chasseur manque de tuer la fille de Balto et celui-ci est obligé de lui avouer le regard des gens sur elle. N'acceptant pas cet héritage, elle s'enfuit pour trouver sa place dans le monde et son père part à sa recherche, hanté par les cauchemars d'un corbeau et d'une meute de loup.
En 1948, un dégénéré désespéré erre dans la jungle et rencontre le diable. Il fait un pacte avec lui où il exige de lui de se transformer périodiquement en bête laide qui ne peut pas être arrêtée...