Dans les années 1980, Ignacio et Enrique se retrouvent. Ensemble ils ont grandi vingt ans auparavant dans une école religieuse et ont tous les deux subi l'omniprésence, les émois sexuels, ainsi que les mauvais traitements du père Manolo, un professeur de littérature et prêtre pédophile passionnément épris d'Ignacio.
Bree (Felicity Huffman), une femme transgenre nommée Stanley Schupak à l'état civil, doit être opérée pour une vaginoplastie; dernière opération de sa transition. Une semaine avant, elle reçoit un coup de téléphone d'un adolescent de 17 ans, Toby Wilkins, qui prétend être son fils et avoir besoin d'aide car il est détenu dans un poste de police de New York.
Fréquentant un lycée de chrétiens born again, Mary et Hillary sont les reines de l'école. Ferventes chrétiennes, elles millitent contre l'avortement, prient pour tout et pour rien et vivent les évangiles pleinement. Alors que Mary vient d'apprendre que son petit ami est homosexuel, elle voit Jésus lui demander de régler ce problème. Elle offre sa virginité à son ami mais n'est pas récompensée : il est toujours homosexuel, ses parents l'envoient effectuer une retraite qui doit le « guérir ». Mary, elle, est tombée enceinte.
Le père Greg Pilkington, jeune prêtre nouvellement affecté à la paroisse de St. Mary dans le centre-ville de Liverpool, est surpris de découvrir que le Père Matthew Thomas qu'il est venu assister est engagé dans une relation sexuelle avec la gouvernante du presbytère, Maria Kerrigan. En outre, le Père Thomas est un radical de gauche et un partisan affiché de la théologie de la libération, le conduisant à des affrontements constants et des querelles avec l'évêque, qui cependant apprécie ses capacités.
À Tel-Aviv, le quartier de Sheikin Street, chic et branché, semble être sur une autre planète. Dans cette « bulle de paix ». Lulu, travaille dans un Body shop, Noam chez un disquaire et Yali tient un café. Tous les trois vivent dans la plus grande insouciance et semblent ignorer les conflits qui les entourent. Mais, tout change le jour où Noam rencontre Ashraf, un Palestinien au physique ravageur. Une relation forte et érotique commence entre les deux hommes. Ashraf s'installe peu à peu dans le groupe et tous l'aident à rester en Israël clandestinement. Le couple devient un symbole de paix et de compréhension mutuelle. Mais l'utopie de ces jeunes est vite rattrapée par la réalité politique et sociale et la violence atroce du quotidien.
Elder Aaron Davis (Steve Sandvoss), un jeune missionnaire mormon originaire de Pocatello (en Idaho), est envoyé à Los Angeles (Californie) pour y rejoindre trois autres jeunes missionnaires et propager la foi mormone. Le groupe habite un bungalow situé juste à côté de celui de Christian Markelli (Wes Ramsey), un jeune gay déluré aspirant à devenir acteur, et de sa colocataire, Julie Taylor (Rebekah Johnson), une apprentie chanteuse. Christian et Julie travaillent comme serveurs au Lila's, un restaurant à la mode dirigé par l’ex-actrice Lila Montagne (Jacqueline Bisset).
L’évêque Bilodeau est appelé en prison pour confesser un détenu. Avec l’aide de codétenus et du personnel carcéral, Simon a monté, pour ce dernier, un événement théâtral qui relate sa propre histoire et son lien avec celle de l’évêque. Alternent dans le récit une succession magistrale de tableaux conjuguant épisodes du passé et scènes de l’événement théâtral en prison. À Roberval, au début du siècle, l’histoire d’amour secrète entre deux adolescents, Simon et , se termine par la mort tragique de Vallier dans un incendie. Même s’il clame son innocence, leur liaison et les apparences font que Simon est encore en prison quarante ans plus tard.
Yossi (Ohad Knoller) est lieutenant d'une section de soldats basée à la frontière entre Israël et le Liban. Il part en reconnaissance avec son sergent, Lior (Yehuda Levi), que tout le monde surnomme Jagger car il ressemble à une star du rock. Yossi est aussi renfermé et taciturne que Lior/Jagger est expansif et extraverti.
Yossi, cardiologue de 34 ans se laisse aller au vague à l'âme. Il est seul et triste. Il rencontre par hasard la mère de son ancien amoureux Lior, mort soldat pendant une opération au Liban il y a dix ans. Déprimé après une visite aux parents de Lior, à qui il révèle sa liaison avec leur fils, il part se changer les idées en vacances à Eilat. Il rencontre en chemin de jeunes soldats. L'un d'eux va transformer sa vie.
Director Reed Cowan, who is a former Mormon missionary, "planned on making a film about gay teen homelessness and suicide in Utah, but switched his focus to Mormon ideology because of how it contributes to the homophobia that causes these problems". The film focuses on the wealth and power of the The Church of Jesus Christ of Latter-day Saints, and how the Church uses the National Organization for Marriage to advocate for denial of rights to lesbian, gay, bisexual, and transgender (LGBT) Americans. It states that LDS Church leader Thomas S. Monson asked to ensure the passage of the controversial California Proposition 8. It also states that many homeless people in Utah are LGBT teens who were abandoned by their Mormon parents.