En 1988, sous la pression internationale, Augusto Pinochet est contraint de consulter le peuple par référendum au sujet de son maintien au pouvoir pour huit années supplémentaires. Pour la première fois depuis le coup d'État du 11 septembre 1973, l'opposition peut s'exprimer librement à la télévision durant 15 minutes par jour dans le cadre de la campagne officielle.
Deux étrangers débarquent dans une ville perdue du Mexique. L'un d'eux est un mariachi qui cherche un endroit où travailler. Le second, Azul, est là pour récupérer la part du butin que son ancien associé Moco lui doit. Les deux hommes partagent des points communs : ils sont vêtus de noir et transportent chacun un étui à guitare. Celui du mariachi contient évidemment une guitare, mais celui d'Azul est truffé d'armes. Les hommes de main de Moco confondent les deux hommes et c'est le début des ennuis pour le mariachi...
Le film s'inspire en partie de l'enfance d'Alfonso Cuarón.
Au début des années 1970, une famille aisée vit à Mexico dans le quartier Colonia Roma . Cleo est une des domestiques d'origine indigène de cette famille avec Adela. La famille est composée des parents Sofía et Antonio, des enfants Sofi, Pepe, Toño et Paco, et de Teresa, la mère de Sofía. Sofia est quittée par son époux. Les deux femmes, Cleo et Sofia, vont s'entraider.
Un antiquaire, grand-père d'une fillette orpheline, découvre par hasard un curieux scarabée en or dans le socle d'une statue d'ange en bois, qu'il est en train de nettoyer dans sa boutique. L'objet intrigue d'autant plus ce professionnel qu'il présente une petite molette. Curieux de comprendre la fonction de ce qui ne semble être qu'un gros bijou en forme de galet tenant parfaitement dans la paume de main, le vieil homme (dont le nom est "Jesús Gris") tourne avec précaution la molette qui n'ouvre pas le scarabée mais se révèle être un remontoir activant un mouvement d'horlogerie ... le compte à rebours vers une forme particulière de "dépendance" est enclenché. Le scarabée ne s'ouvre pas, ce n'est pas une boîte précieuse et décorative, mais c'est quand même une boîte de Pandore au mécanisme très sophistiqué.
Mexico. Ana à genoux fait un mouvement de va-et-vient avec dans sa bouche le sexe bandé de l'homme nu qui se tient debout devant elle. Le métro, la circulation. Marcos Hernández chauffeur d'un général, a enlevé avec sa femme un bébé, qui meurt de manière accidentelle. Très éprouvé, il se confie à Ana, la fille de son patron qui se prostitue par plaisir. Après s'être offerte à lui, le laissant sans jouissance, elle lui conseille de se rendre à la police. Face à toutes les festivités, malgré sa femme qui tente de le retenir, il sombre. Ana est son refuge : il la poignarde. Immédiatement, la police se met à sa recherche. Il se dirige à genoux vers la basilique Notre-Dame de Guadalupe où il finit par s'effondrer. Bouclant avec la première scène, Ana et lui se retrouvent dans la même posture qu'au début du film, sauf qu'ils se parlent, échangent sourires et mots d'amour.
Un homme ressemblant au Christ s'introduit dans une tour et y affronte un maître alchimiste. Après l'avoir vaincu, ce dernier lui fait parcourir les premières étapes d'une initiation, puis lui présente sept personnes qui font partie des puissants de ce monde, chacun d'entre eux étant associé à une planète (au sens astrologique). Ces hommes et ces femmes sont prêts à tout abandonner pour obtenir le secret de l'immortalité. Le maître leur a promis de les conduire jusqu'aux neuf sages qui le détiennent au sommet de la Montagne sacrée...
Dans une Caracas chaotique, Armando est un homme seul ayant dépassé la cinquantaine qui gère un labo de prothèses dentaires. À un arrêt de bus, il drague des jeunes garçons pour les faire venir chez lui, sans jamais les toucher. Il épie également un vieil homme avec lequel il semble avoir eu un lien traumatique. Un jour, il fait la connaissance de Élder qui commence à fréquenter Armando, d'abord pour de l'argent puis pour des raisons autres.
Sara et Adolfo, les enfants d'un jeune couple en route vers Tijuana disparaissent une journée dans la caverne d'une montagne. Tandis qu'il se comportent bizzarement depuis leur retour, leur père entreprend une enquête sur des légendes indiennes.
Deux enfants prennent un livre dans une poubelle. Ils commencent à lire l'histoire d'un quartier pauvre de la ville de Mexico. Le charpentier Pepe "El Toro" (Pedro Infante) vit avec sa fille adoptive "Chachita" (Evita Muñoz) et fait la cour à la jolie Celia, connue comme "La Chorreada" (Blanca Estela Pavón). Autour d'eux, un groupe de gens vivent leur vie de nombreuses façons différentes: il y a une paire de femmes toujours ivres, connues comme "La Tostada" (La Grillée) et "La Guayaba" (La Goyave); une belle femme (Katy Jurado) qui dort tout le temps, surnommée "La que se levanta" tarde (Celle qui se réveille tard); et une mystérieuse prostituée nommée "La Tisica" (Celle qui est montée), qui souffre de tuberculose et qui a un sombre passé.
Alors que sa mère a disparu, Estrella trouve refuge auprès d'un groupe de quatre garçons orphelins. Effrayée par une présence étrange, la jeune fille commence à douter de ce qui l'entoure...
Un archéologue lègue un codex secret et une carte, menant à un fabuleux trésor aztèque, au docteur Trelles avant d'être assassiné par le gang du Dragon Noir. Se sachant également poursuivi par cette société secrète, Trelles le brise en trois morceaux et les donne à deux sœurs lutteuses, Gloria Venus et Golden Rubí, ainsi qu'au fiancé de l'une d'entre elles, Armando. Ce dernier a notamment été averti par l'archéologue lors d'un combat entre les deux filles que Trelles était en danger. Pendant ce temps, le Dragon noir kidnappe Chela, la fille d'un scientifique décédé, afin de la manipuler mentalement. Elle réussit à voler les deux morceaux confiés aux deux sœurs après les avoir droguées. Pourtant, le gang collabore avec elles pour qu'elles déchiffrent le codex, pénètrent dans la pyramide et qu'elles dérobent le trésor. Malheureusement, elles libèrent une momie aztèque, capable de se transformer en chauve-souris ou en serpent, et devront confronter le Prince Fugiyato, le chef du Dragon Noir, ainsi que sa bande de lutteuses.
Le Zorro écarlate doit affronter trois mystères : une diligence qui disparaît, la mort de propriétaires terriens et un peuple terrifié par le maléfique El Látigo.
Luis et son compagnon de voyage Pascual arrivent dans un village où se déroule l'exécution publique de Tomás García. Celui-ci est pendu pour meurtre. Alors que son corps est laissé exposé pour servir d'exemple, il est volé durant la nuit par sa mère. Sorcière, elle utilise la magie pour ressusciter son fils. Revenu sous une apparence monstrueuse et contrôlé par sa mère, le zombie s'attaque à tous ceux qui ont participé à sa mort. Les victimes sont retrouvées étranglées par un foulard ou une corde de pendaison.
Le Docteur Kracken, un scientifique fou, cherche le secret de la vie éternelle. Il découvre un squelette animé parlant qui s'avère être la sorcière déjà aperçue dans le film précédent. Kracken l'aide à ranimer son monstrueux fils et cherche un moyen pour lui rendre son corps. Pour leurs expériences, ils envoient le monstre enlever de jeunes femmes.